Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms