Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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