Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms