Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK8

FAM46D, Putative nucleotidyltransferase FAM46D, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46DQ8NEK8 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms