Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms