Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVD9

NUDCD3, NudC domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD3Q8IVD9 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms