Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms