Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms