Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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