Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4F4

ZFYVE27, Protrudin, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE27Q5T4F4 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZFYVE27Q5T4F4 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms