Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 SATB2-AS1-205ENST00000450728 3314 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 CTCFL-204ENST00000422869 2966 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 AC005096.1-201ENST00000560499 622 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 TRPC7-201ENST00000352189 2241 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 NCAM1-202ENST00000401611 2510 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 GBP1P1-201ENST00000394662 1740 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 ADGRE4P-201ENST00000597372 1810 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 INTS6L-201ENST00000370752 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 WBP1L-202ENST00000448841 4085 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 AC009336.2-201ENST00000468418 3521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 HYOU1-217ENST00000612687 4360 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 HJURP-202ENST00000411486 3187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 LRG1-201ENST00000306390 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 ZNF720-211ENST00000539915 837 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms