Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms