Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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