Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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