Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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SGCAQ16586 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCAQ16586 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCAQ16586 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCAQ16586 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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SGCAQ16586 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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SGCAQ16586 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCAQ16586 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCAQ16586 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCAQ16586 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCAQ16586 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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SGCAQ16586 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCAQ16586 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCAQ16586 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCAQ16586 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCAQ16586 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCAQ16586 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCAQ16586 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCAQ16586 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCAQ16586 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCAQ16586 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCAQ16586 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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