Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms