Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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SSX1Q16384 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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SSX1Q16384 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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SSX1Q16384 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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SSX1Q16384 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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SSX1Q16384 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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