Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 TNRC6C-201ENST00000301624 9632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 GPR12-202ENST00000405846 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 SPART-203ENST00000451493 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 DNMT1-202ENST00000359526 5206 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 PBX1-203ENST00000420696 6636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 TPX2-202ENST00000340513 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 PIK3AP1-201ENST00000339364 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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VAMP3Q15836 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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VAMP3Q15836 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 FLNA-219ENST00000610817 7595 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 RAP1GAP2-201ENST00000254695 6661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 FER1L5-204ENST00000623019 6477 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 ADAMTS10-211ENST00000597188 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 TBCD-201ENST00000355528 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 AL358933.1-201ENST00000565046 2830 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 VPS13A-205ENST00000376636 11145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 DENND4C-205ENST00000434457 6718 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 BTBD3-204ENST00000405977 5137 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 NBN-201ENST00000265433 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 PI4KB-204ENST00000368875 3983 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 CCBE1-202ENST00000439986 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 JCAD-201ENST00000375377 9265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 CABIN1-201ENST00000263119 7222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 TG-201ENST00000220616 8450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 POLE-201ENST00000320574 7840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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