Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms