Protein–RNA interactions for Protein: Q15652

JMJD1C, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 2,540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1CQ15652 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
JMJD1CQ15652 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
JMJD1CQ15652 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
JMJD1CQ15652 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
JMJD1CQ15652 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
JMJD1CQ15652 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
JMJD1CQ15652 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
JMJD1CQ15652 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
JMJD1CQ15652 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
JMJD1CQ15652 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
JMJD1CQ15652 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
JMJD1CQ15652 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
JMJD1CQ15652 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
JMJD1CQ15652 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
JMJD1CQ15652 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
JMJD1CQ15652 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
JMJD1CQ15652 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms