Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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