Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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UBE3CQ15386 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
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