Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms