Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms