Protein–RNA interactions for Protein: Q14094

CCNI, Cyclin-I, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNIQ14094 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms