Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms