Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms