Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME3Q13232 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME3Q13232 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME3Q13232 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME3Q13232 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME3Q13232 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME3Q13232 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME3Q13232 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME3Q13232 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NME3Q13232 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME3Q13232 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME3Q13232 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME3Q13232 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME3Q13232 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME3Q13232 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME3Q13232 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME3Q13232 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME3Q13232 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME3Q13232 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME3Q13232 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME3Q13232 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME3Q13232 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME3Q13232 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME3Q13232 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME3Q13232 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME3Q13232 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME3Q13232 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME3Q13232 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME3Q13232 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME3Q13232 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME3Q13232 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME3Q13232 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NME3Q13232 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME3Q13232 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME3Q13232 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME3Q13232 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME3Q13232 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME3Q13232 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME3Q13232 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME3Q13232 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME3Q13232 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME3Q13232 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME3Q13232 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NME3Q13232 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME3Q13232 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME3Q13232 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME3Q13232 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NME3Q13232 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME3Q13232 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME3Q13232 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME3Q13232 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME3Q13232 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME3Q13232 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME3Q13232 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME3Q13232 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME3Q13232 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME3Q13232 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME3Q13232 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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NME3Q13232 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME3Q13232 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME3Q13232 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME3Q13232 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME3Q13232 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME3Q13232 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME3Q13232 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME3Q13232 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME3Q13232 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME3Q13232 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME3Q13232 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME3Q13232 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME3Q13232 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME3Q13232 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME3Q13232 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NME3Q13232 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME3Q13232 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME3Q13232 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME3Q13232 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME3Q13232 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME3Q13232 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME3Q13232 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME3Q13232 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME3Q13232 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME3Q13232 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME3Q13232 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME3Q13232 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME3Q13232 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME3Q13232 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME3Q13232 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME3Q13232 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME3Q13232 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME3Q13232 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME3Q13232 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NME3Q13232 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME3Q13232 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME3Q13232 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME3Q13232 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME3Q13232 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME3Q13232 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME3Q13232 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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