Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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CBX3Q13185 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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CBX3Q13185 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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CBX3Q13185 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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CBX3Q13185 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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