Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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