Protein–RNA interactions for Protein: Q12982

BNIP2, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP2Q12982 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BNIP2Q12982 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms