Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC10A2Q12908 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC10A2Q12908 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC10A2Q12908 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC10A2Q12908 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC10A2Q12908 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC10A2Q12908 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC10A2Q12908 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC10A2Q12908 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC10A2Q12908 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC10A2Q12908 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC10A2Q12908 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC10A2Q12908 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC10A2Q12908 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC10A2Q12908 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC10A2Q12908 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC10A2Q12908 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC10A2Q12908 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC10A2Q12908 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC10A2Q12908 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC10A2Q12908 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC10A2Q12908 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC10A2Q12908 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC10A2Q12908 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC10A2Q12908 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC10A2Q12908 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC10A2Q12908 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC10A2Q12908 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC10A2Q12908 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC10A2Q12908 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC10A2Q12908 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC10A2Q12908 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC10A2Q12908 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC10A2Q12908 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC10A2Q12908 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC10A2Q12908 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC10A2Q12908 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC10A2Q12908 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC10A2Q12908 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC10A2Q12908 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC10A2Q12908 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC10A2Q12908 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC10A2Q12908 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC10A2Q12908 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC10A2Q12908 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC10A2Q12908 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC10A2Q12908 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC10A2Q12908 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC10A2Q12908 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC10A2Q12908 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC10A2Q12908 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC10A2Q12908 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC10A2Q12908 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC10A2Q12908 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC10A2Q12908 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC10A2Q12908 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms