Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
COX10Q12887 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
COX10Q12887 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
COX10Q12887 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
COX10Q12887 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
COX10Q12887 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
COX10Q12887 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
COX10Q12887 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
COX10Q12887 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
COX10Q12887 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
COX10Q12887 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
COX10Q12887 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
COX10Q12887 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
COX10Q12887 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
COX10Q12887 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
COX10Q12887 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
COX10Q12887 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
COX10Q12887 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
COX10Q12887 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
COX10Q12887 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
COX10Q12887 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
COX10Q12887 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
COX10Q12887 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
COX10Q12887 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
COX10Q12887 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
COX10Q12887 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
COX10Q12887 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
COX10Q12887 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
COX10Q12887 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
COX10Q12887 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
COX10Q12887 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
COX10Q12887 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
COX10Q12887 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
COX10Q12887 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
COX10Q12887 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
COX10Q12887 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
COX10Q12887 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
COX10Q12887 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
COX10Q12887 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
COX10Q12887 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
COX10Q12887 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
COX10Q12887 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
COX10Q12887 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
COX10Q12887 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
COX10Q12887 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
COX10Q12887 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
COX10Q12887 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
COX10Q12887 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
COX10Q12887 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
COX10Q12887 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
COX10Q12887 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
COX10Q12887 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
COX10Q12887 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
COX10Q12887 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
COX10Q12887 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
COX10Q12887 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
COX10Q12887 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
COX10Q12887 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
COX10Q12887 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
COX10Q12887 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
COX10Q12887 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
COX10Q12887 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
COX10Q12887 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
COX10Q12887 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
COX10Q12887 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
COX10Q12887 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
COX10Q12887 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
COX10Q12887 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
COX10Q12887 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
COX10Q12887 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
COX10Q12887 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
COX10Q12887 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
COX10Q12887 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
COX10Q12887 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
COX10Q12887 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
COX10Q12887 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
COX10Q12887 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
COX10Q12887 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
COX10Q12887 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
COX10Q12887 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
COX10Q12887 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
COX10Q12887 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
COX10Q12887 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
COX10Q12887 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
COX10Q12887 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
COX10Q12887 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
COX10Q12887 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
COX10Q12887 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
COX10Q12887 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
COX10Q12887 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
COX10Q12887 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
COX10Q12887 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
COX10Q12887 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
COX10Q12887 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
COX10Q12887 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
COX10Q12887 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
COX10Q12887 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
COX10Q12887 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
COX10Q12887 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
COX10Q12887 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms