Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCC8Q09428 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCC8Q09428 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCC8Q09428 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCC8Q09428 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCC8Q09428 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms