Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
LTBQ06643 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LTBQ06643 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LTBQ06643 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LTBQ06643 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LTBQ06643 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LTBQ06643 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LTBQ06643 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LTBQ06643 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LTBQ06643 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LTBQ06643 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LTBQ06643 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LTBQ06643 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LTBQ06643 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LTBQ06643 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LTBQ06643 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LTBQ06643 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LTBQ06643 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LTBQ06643 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LTBQ06643 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LTBQ06643 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LTBQ06643 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LTBQ06643 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LTBQ06643 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LTBQ06643 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LTBQ06643 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LTBQ06643 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LTBQ06643 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LTBQ06643 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LTBQ06643 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LTBQ06643 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LTBQ06643 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LTBQ06643 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LTBQ06643 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
LTBQ06643 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LTBQ06643 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LTBQ06643 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LTBQ06643 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LTBQ06643 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LTBQ06643 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LTBQ06643 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
LTBQ06643 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LTBQ06643 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LTBQ06643 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LTBQ06643 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LTBQ06643 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
LTBQ06643 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
LTBQ06643 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LTBQ06643 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LTBQ06643 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LTBQ06643 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LTBQ06643 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LTBQ06643 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LTBQ06643 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LTBQ06643 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LTBQ06643 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
LTBQ06643 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LTBQ06643 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LTBQ06643 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LTBQ06643 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LTBQ06643 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LTBQ06643 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LTBQ06643 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LTBQ06643 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LTBQ06643 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
LTBQ06643 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LTBQ06643 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LTBQ06643 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LTBQ06643 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LTBQ06643 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LTBQ06643 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LTBQ06643 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LTBQ06643 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LTBQ06643 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LTBQ06643 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LTBQ06643 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LTBQ06643 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LTBQ06643 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LTBQ06643 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LTBQ06643 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LTBQ06643 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LTBQ06643 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LTBQ06643 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LTBQ06643 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LTBQ06643 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LTBQ06643 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LTBQ06643 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LTBQ06643 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LTBQ06643 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LTBQ06643 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LTBQ06643 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LTBQ06643 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LTBQ06643 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LTBQ06643 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LTBQ06643 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LTBQ06643 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
LTBQ06643 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LTBQ06643 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LTBQ06643 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LTBQ06643 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms