Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms