Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms