Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RAE1P78406 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAE1P78406 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAE1P78406 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAE1P78406 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAE1P78406 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAE1P78406 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAE1P78406 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAE1P78406 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAE1P78406 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAE1P78406 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAE1P78406 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAE1P78406 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAE1P78406 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAE1P78406 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAE1P78406 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAE1P78406 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAE1P78406 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAE1P78406 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAE1P78406 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAE1P78406 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAE1P78406 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAE1P78406 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAE1P78406 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAE1P78406 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAE1P78406 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAE1P78406 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAE1P78406 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAE1P78406 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAE1P78406 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAE1P78406 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAE1P78406 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAE1P78406 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAE1P78406 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAE1P78406 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAE1P78406 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAE1P78406 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAE1P78406 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAE1P78406 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAE1P78406 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAE1P78406 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAE1P78406 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAE1P78406 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAE1P78406 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAE1P78406 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAE1P78406 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAE1P78406 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAE1P78406 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAE1P78406 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAE1P78406 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAE1P78406 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAE1P78406 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAE1P78406 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAE1P78406 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAE1P78406 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAE1P78406 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAE1P78406 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAE1P78406 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAE1P78406 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAE1P78406 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAE1P78406 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAE1P78406 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAE1P78406 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAE1P78406 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAE1P78406 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAE1P78406 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAE1P78406 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAE1P78406 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAE1P78406 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAE1P78406 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAE1P78406 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAE1P78406 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAE1P78406 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAE1P78406 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAE1P78406 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAE1P78406 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAE1P78406 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAE1P78406 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAE1P78406 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAE1P78406 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RAE1P78406 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAE1P78406 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RAE1P78406 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAE1P78406 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RAE1P78406 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RAE1P78406 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAE1P78406 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RAE1P78406 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAE1P78406 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAE1P78406 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RAE1P78406 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAE1P78406 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAE1P78406 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAE1P78406 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAE1P78406 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAE1P78406 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAE1P78406 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAE1P78406 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAE1P78406 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAE1P78406 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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