Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P63132 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P63132 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P63132 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P63132 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P63132 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P63132 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P63132 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P63132 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P63132 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P63132 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P63132 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P63132 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P63132 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P63132 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P63132 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P63132 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P63132 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P63132 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P63132 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P63132 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P63132 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P63132 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P63132 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P63132 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P63132 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P63132 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P63132 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P63132 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P63132 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P63132 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P63132 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms