Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC11A1P49279 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms