Protein–RNA interactions for Protein: P48047

ATP5O, ATP synthase subunit O, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5OP48047 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms