Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRXP46100 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRXP46100 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRXP46100 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRXP46100 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRXP46100 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRXP46100 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRXP46100 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRXP46100 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRXP46100 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRXP46100 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRXP46100 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRXP46100 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRXP46100 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRXP46100 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRXP46100 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRXP46100 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRXP46100 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRXP46100 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRXP46100 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRXP46100 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRXP46100 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRXP46100 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRXP46100 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRXP46100 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRXP46100 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRXP46100 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRXP46100 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRXP46100 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRXP46100 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRXP46100 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRXP46100 DIO3OS-211ENST00000557532 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRXP46100 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRXP46100 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRXP46100 UBA52-214ENST00000599595 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRXP46100 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRXP46100 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRXP46100 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRXP46100 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRXP46100 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRXP46100 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRXP46100 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRXP46100 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRXP46100 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRXP46100 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRXP46100 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
ATRXP46100 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
ATRXP46100 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRXP46100 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRXP46100 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRXP46100 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRXP46100 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRXP46100 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRXP46100 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRXP46100 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRXP46100 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRXP46100 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRXP46100 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRXP46100 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRXP46100 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRXP46100 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRXP46100 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRXP46100 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRXP46100 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRXP46100 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRXP46100 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRXP46100 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRXP46100 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRXP46100 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRXP46100 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRXP46100 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRXP46100 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRXP46100 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRXP46100 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRXP46100 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AC022121.1-201ENST00000484584 579 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRXP46100 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRXP46100 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRXP46100 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRXP46100 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRXP46100 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRXP46100 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRXP46100 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRXP46100 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRXP46100 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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