Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MDH1P40925 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MDH1P40925 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MDH1P40925 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MDH1P40925 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MDH1P40925 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MDH1P40925 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MDH1P40925 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MDH1P40925 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MDH1P40925 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MDH1P40925 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MDH1P40925 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MDH1P40925 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MDH1P40925 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MDH1P40925 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MDH1P40925 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MDH1P40925 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MDH1P40925 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MDH1P40925 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MDH1P40925 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MDH1P40925 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MDH1P40925 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MDH1P40925 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MDH1P40925 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MDH1P40925 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MDH1P40925 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MDH1P40925 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MDH1P40925 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MDH1P40925 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MDH1P40925 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MDH1P40925 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MDH1P40925 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MDH1P40925 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MDH1P40925 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MDH1P40925 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MDH1P40925 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MDH1P40925 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MDH1P40925 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MDH1P40925 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MDH1P40925 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MDH1P40925 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MDH1P40925 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MDH1P40925 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MDH1P40925 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MDH1P40925 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MDH1P40925 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MDH1P40925 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MDH1P40925 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MDH1P40925 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MDH1P40925 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MDH1P40925 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MDH1P40925 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MDH1P40925 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MDH1P40925 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MDH1P40925 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MDH1P40925 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MDH1P40925 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MDH1P40925 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MDH1P40925 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MDH1P40925 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MDH1P40925 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MDH1P40925 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MDH1P40925 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MDH1P40925 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MDH1P40925 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MDH1P40925 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MDH1P40925 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MDH1P40925 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MDH1P40925 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MDH1P40925 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MDH1P40925 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MDH1P40925 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MDH1P40925 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MDH1P40925 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MDH1P40925 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MDH1P40925 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MDH1P40925 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MDH1P40925 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MDH1P40925 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MDH1P40925 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MDH1P40925 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MDH1P40925 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MDH1P40925 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MDH1P40925 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MDH1P40925 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MDH1P40925 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MDH1P40925 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MDH1P40925 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MDH1P40925 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MDH1P40925 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MDH1P40925 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MDH1P40925 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MDH1P40925 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MDH1P40925 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MDH1P40925 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MDH1P40925 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MDH1P40925 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MDH1P40925 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MDH1P40925 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MDH1P40925 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms