Protein–RNA interactions for Protein: P40617

ARL4A, ADP-ribosylation factor-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4AP40617 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL4AP40617 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL4AP40617 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL4AP40617 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL4AP40617 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL4AP40617 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL4AP40617 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL4AP40617 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL4AP40617 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL4AP40617 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL4AP40617 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL4AP40617 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL4AP40617 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL4AP40617 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL4AP40617 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL4AP40617 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL4AP40617 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL4AP40617 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL4AP40617 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL4AP40617 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL4AP40617 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL4AP40617 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL4AP40617 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL4AP40617 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL4AP40617 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL4AP40617 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL4AP40617 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL4AP40617 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL4AP40617 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARL4AP40617 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms