Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL1P40616 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL1P40616 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL1P40616 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL1P40616 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL1P40616 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL1P40616 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL1P40616 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL1P40616 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL1P40616 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL1P40616 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL1P40616 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL1P40616 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL1P40616 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL1P40616 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL1P40616 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL1P40616 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL1P40616 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL1P40616 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL1P40616 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL1P40616 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL1P40616 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL1P40616 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL1P40616 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL1P40616 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL1P40616 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL1P40616 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL1P40616 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL1P40616 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL1P40616 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL1P40616 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL1P40616 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL1P40616 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL1P40616 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL1P40616 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL1P40616 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL1P40616 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL1P40616 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL1P40616 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL1P40616 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL1P40616 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL1P40616 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL1P40616 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL1P40616 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL1P40616 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL1P40616 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL1P40616 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL1P40616 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL1P40616 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL1P40616 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL1P40616 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL1P40616 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL1P40616 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL1P40616 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL1P40616 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL1P40616 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL1P40616 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL1P40616 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL1P40616 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL1P40616 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL1P40616 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL1P40616 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL1P40616 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL1P40616 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL1P40616 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL1P40616 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL1P40616 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL1P40616 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL1P40616 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL1P40616 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL1P40616 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL1P40616 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL1P40616 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL1P40616 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL1P40616 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL1P40616 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL1P40616 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms