Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GJC1P36383 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GJC1P36383 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJC1P36383 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJC1P36383 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJC1P36383 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJC1P36383 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJC1P36383 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GJC1P36383 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJC1P36383 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJC1P36383 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJC1P36383 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJC1P36383 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJC1P36383 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJC1P36383 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJC1P36383 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJC1P36383 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJC1P36383 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJC1P36383 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJC1P36383 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJC1P36383 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJC1P36383 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJC1P36383 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GJC1P36383 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJC1P36383 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJC1P36383 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJC1P36383 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJC1P36383 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJC1P36383 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJC1P36383 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJC1P36383 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJC1P36383 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJC1P36383 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GJC1P36383 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJC1P36383 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJC1P36383 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJC1P36383 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJC1P36383 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJC1P36383 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJC1P36383 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GJC1P36383 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJC1P36383 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GJC1P36383 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GJC1P36383 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJC1P36383 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GJC1P36383 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GJC1P36383 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GJC1P36383 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJC1P36383 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJC1P36383 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJC1P36383 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJC1P36383 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJC1P36383 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJC1P36383 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GJC1P36383 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJC1P36383 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJC1P36383 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJC1P36383 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJC1P36383 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJC1P36383 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJC1P36383 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJC1P36383 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJC1P36383 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJC1P36383 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJC1P36383 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJC1P36383 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJC1P36383 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GJC1P36383 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GJC1P36383 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GJC1P36383 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GJC1P36383 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GJC1P36383 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GJC1P36383 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GJC1P36383 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GJC1P36383 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GJC1P36383 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJC1P36383 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJC1P36383 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJC1P36383 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJC1P36383 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJC1P36383 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJC1P36383 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJC1P36383 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJC1P36383 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJC1P36383 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJC1P36383 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GJC1P36383 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJC1P36383 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJC1P36383 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJC1P36383 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GJC1P36383 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GJC1P36383 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GJC1P36383 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJC1P36383 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJC1P36383 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJC1P36383 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJC1P36383 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJC1P36383 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJC1P36383 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJC1P36383 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms