Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms