Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

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Length 558 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GPC1P35052 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GPC1P35052 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GPC1P35052 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GPC1P35052 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GPC1P35052 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GPC1P35052 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GPC1P35052 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GPC1P35052 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GPC1P35052 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GPC1P35052 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GPC1P35052 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GPC1P35052 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GPC1P35052 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GPC1P35052 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GPC1P35052 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
GPC1P35052 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GPC1P35052 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GPC1P35052 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
GPC1P35052 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GPC1P35052 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GPC1P35052 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
GPC1P35052 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GPC1P35052 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GPC1P35052 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
GPC1P35052 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GPC1P35052 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GPC1P35052 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
GPC1P35052 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GPC1P35052 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
GPC1P35052 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
GPC1P35052 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
GPC1P35052 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
GPC1P35052 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GPC1P35052 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GPC1P35052 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GPC1P35052 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GPC1P35052 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GPC1P35052 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GPC1P35052 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GPC1P35052 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GPC1P35052 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GPC1P35052 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GPC1P35052 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GPC1P35052 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GPC1P35052 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GPC1P35052 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GPC1P35052 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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GPC1P35052 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GPC1P35052 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GPC1P35052 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GPC1P35052 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GPC1P35052 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
GPC1P35052 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GPC1P35052 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GPC1P35052 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GPC1P35052 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GPC1P35052 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GPC1P35052 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GPC1P35052 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GPC1P35052 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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GPC1P35052 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GPC1P35052 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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GPC1P35052 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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GPC1P35052 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GPC1P35052 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GPC1P35052 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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GPC1P35052 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
GPC1P35052 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GPC1P35052 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GPC1P35052 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GPC1P35052 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GPC1P35052 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GPC1P35052 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GPC1P35052 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GPC1P35052 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GPC1P35052 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GPC1P35052 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GPC1P35052 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GPC1P35052 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GPC1P35052 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GPC1P35052 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GPC1P35052 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GPC1P35052 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GPC1P35052 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GPC1P35052 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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