Protein–RNA interactions for Protein: P32248

CCR7, C-C chemokine receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR7P32248 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCR7P32248 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCR7P32248 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCR7P32248 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCR7P32248 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCR7P32248 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCR7P32248 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCR7P32248 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCR7P32248 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCR7P32248 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCR7P32248 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCR7P32248 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCR7P32248 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCR7P32248 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCR7P32248 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCR7P32248 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCR7P32248 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCR7P32248 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCR7P32248 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCR7P32248 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCR7P32248 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCR7P32248 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCR7P32248 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCR7P32248 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCR7P32248 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCR7P32248 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCR7P32248 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCR7P32248 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCR7P32248 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCR7P32248 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCR7P32248 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCR7P32248 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CCR7P32248 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CCR7P32248 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCR7P32248 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCR7P32248 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCR7P32248 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCR7P32248 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCR7P32248 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCR7P32248 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCR7P32248 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCR7P32248 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCR7P32248 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCR7P32248 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCR7P32248 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCR7P32248 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCR7P32248 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCR7P32248 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCR7P32248 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCR7P32248 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCR7P32248 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCR7P32248 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCR7P32248 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCR7P32248 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCR7P32248 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCR7P32248 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCR7P32248 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCR7P32248 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCR7P32248 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCR7P32248 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCR7P32248 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCR7P32248 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCR7P32248 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCR7P32248 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCR7P32248 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCR7P32248 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCR7P32248 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCR7P32248 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCR7P32248 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCR7P32248 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCR7P32248 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCR7P32248 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCR7P32248 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCR7P32248 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCR7P32248 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCR7P32248 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCR7P32248 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCR7P32248 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCR7P32248 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCR7P32248 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCR7P32248 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCR7P32248 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCR7P32248 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCR7P32248 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCR7P32248 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCR7P32248 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCR7P32248 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCR7P32248 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCR7P32248 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCR7P32248 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCR7P32248 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCR7P32248 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCR7P32248 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCR7P32248 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCR7P32248 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCR7P32248 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCR7P32248 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCR7P32248 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCR7P32248 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCR7P32248 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms