Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFNP31947 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFNP31947 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFNP31947 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFNP31947 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFNP31947 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFNP31947 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFNP31947 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFNP31947 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFNP31947 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFNP31947 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFNP31947 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFNP31947 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFNP31947 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFNP31947 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFNP31947 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFNP31947 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFNP31947 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFNP31947 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFNP31947 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFNP31947 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SFNP31947 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFNP31947 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFNP31947 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFNP31947 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFNP31947 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFNP31947 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFNP31947 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFNP31947 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFNP31947 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFNP31947 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFNP31947 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFNP31947 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFNP31947 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SFNP31947 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFNP31947 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFNP31947 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SFNP31947 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFNP31947 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFNP31947 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFNP31947 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFNP31947 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFNP31947 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFNP31947 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFNP31947 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFNP31947 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFNP31947 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SFNP31947 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFNP31947 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFNP31947 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFNP31947 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFNP31947 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFNP31947 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFNP31947 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFNP31947 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFNP31947 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFNP31947 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFNP31947 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFNP31947 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFNP31947 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFNP31947 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SFNP31947 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFNP31947 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFNP31947 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFNP31947 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFNP31947 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFNP31947 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SFNP31947 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFNP31947 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFNP31947 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFNP31947 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFNP31947 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFNP31947 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFNP31947 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFNP31947 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFNP31947 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFNP31947 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFNP31947 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFNP31947 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFNP31947 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFNP31947 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFNP31947 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFNP31947 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFNP31947 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFNP31947 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFNP31947 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFNP31947 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFNP31947 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFNP31947 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFNP31947 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFNP31947 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFNP31947 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFNP31947 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFNP31947 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFNP31947 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFNP31947 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFNP31947 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFNP31947 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFNP31947 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFNP31947 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms